K-Index nebyl spočítán pro následující organizace, které mají méně než 60 smluv za rok nebo malý objem smluv.
Výzkumný ústav práce a sociálních věcí, v. v. i., Ústav pro jazyk český AV ČR, v. v. i., Etnologický ústav AV ČR, v. v. i., Ústav biologie obratlovců AV ČR, v.v.i., Orientální ústav AV ČR, v. v. i., Psychologický ústav AV ČR, v. v. i., Centrum pro studium vysokého školství, v.v.i., Ústav pro českou literaturu AV ČR, v.v.i., Ústav teorie informace a automatizace AV ČR, v. v. i., Matematický ústav AV ČR, v. v. i., Masarykův ústav a Archiv AV ČR, v. v. i., Slovanský ústav AV ČR, v. v. i., Ústav analytické chemie AV ČR,v. v. i., Astronomický ústav AV ČR, v. v. i., Institut lázeňství a balneologie, v. v. i., Výzkumný ústav geodetický, topografický a kartografický, v. v. i., Ústav pro soudobé dějiny AV ČR, v. v. i., Ústav fyziky atmosféry AV ČR, v. v. i., Výzkumný ústav bezpečnosti práce, v. v. i., Ústav státu a práva AV ČR, v. v. i., Ústav pro hydrodynamiku AV ČR, v. v. i., Výzkumný ústav zemědělské techniky, v.v.i., Výzkumný ústav potravinářský Praha,v. v. i., Historický ústav AV ČR, v. v. i., Výzkumný institut ochrany genofondů, v. v. i., Ústav archeologické památkové péče severozápadních Čech, v. v. i., Výzkumný ústav balneologický, v. v. i., Ústav mezinárodních vztahů, v.v.i., Centrum pro výzkum energetického využití litosféry, v.v. i., Ústav archeologické památkové péče Brno, veřejná výzkumná instituce