| Ministerstvo zdravotnictví | 78 | 3 521 084 866 Kč |
| Horské lázně Karlova Studánka, státní podnik | 52 | 115 599 499 Kč |
| Státní léčebné lázně Janské Lázně, státní podnik | 49 | 92 324 677 Kč |
| Koordinační středisko pro resortní zdravotnické informační systémy | 15 | 831 054 739 Kč |
| Koordinační středisko transplantací | 1 | 4 238 407 Kč |
| Státní zdravotní ústav | 415 | 1 799 082 799 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Brně | 3 | 1 367 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Praze | 7 | 53 830 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Pardubicích | 3 | 2 049 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Karlových Varech | 1 | 263 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Plzni | 6 | 13 597 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Liberci | 3 | 1 362 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Jihlavě | 5 | 2 196 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Českých Budějovicích | 3 | 1 634 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě | 91 | 595 628 574 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Kolíně | 4 | 3 369 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem | 84 | 116 586 066 Kč |
| Krajská hygienická stanice Jihočeského kraje se sídlem v Českých Budějovicích | 21 | 14 693 539 Kč |
| Krajská hygienická stanice kraje Vysočina se sídlem v Jihlavě | 17 | 20 427 962 Kč |
| Krajská hygienická stanice Libereckého kraje se sídlem v Liberci | 20 | 1 200 000 Kč |
| Krajská hygienická stanice Plzeňského kraje se sídlem v Plzni | 14 | 14 712 145 Kč |
| Krajská hygienická stanice Karlovarského kraje se sídlem v Karlových Varech | 21 | 7 224 969 Kč |
| Krajská hygienická stanice Pardubického kraje se sídlem v Pardubicích | 8 | 4 842 734 Kč |
| Krajská hygienická stanice Královéhradeckého kraje se sídlem v Hradci Králové | 24 | 25 599 279 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Hradci Králové | 9 | 12 340 945 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem ve Zlíně | 3 | 509 000 Kč |
| Zdravotní ústav se sídlem v Olomouci | 3 | 1 781 000 Kč |
| Masarykův onkologický ústav | 323 | 7 429 012 180 Kč |
| Nadace BONA | 3 | 22 807 725 Kč |
| Rehabilitační ústav Hrabyně | 42 | 272 268 920 Kč |
| Psychiatrická nemocnice v Kroměříži | 14 | 354 005 407 Kč |
| Centrum kardiovaskulární a transplantační chirurgie Brno | 41 | 359 176 457 Kč |
| Rehabilitační ústav Kladruby | 29 | 574 962 700 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Kosmonosy | 34 | 250 870 946 Kč |
| Mosty Prahy 14, z. s. | 1 | 11 060 823 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Bohnice | 127 | 1 105 725 378 Kč |
| Fakultní nemocnice Bulovka | 322 | 1 798 522 984 Kč |
| Fakultní nemocnice Motol a Homolka | 866 | 20 565 862 381 Kč |
| Fakultní Thomayerova nemocnice | 429 | 3 280 073 112 Kč |
| Fakultní nemocnice Královské Vinohrady | 466 | 3 937 647 378 Kč |
| Všeobecná fakultní nemocnice v Praze | 1 084 | 5 207 996 785 Kč |
| Nemocnice Na Homolce | 96 | 1 612 733 463 Kč |
| Národní centrum ošetřovatelství a nelékařských zdravotnických oborů | 44 | 692 978 534 Kč |
| Institut postgraduálního vzdělávání ve zdravotnictví | 73 | 713 031 251 Kč |
| Ústav zdravotnických informací a statistiky ČR | 61 | 1 961 922 581 Kč |
| Národní lékařská knihovna | 5 | 3 497 892 Kč |
| Státní ústav pro kontrolu léčiv | 6 | 112 543 791 Kč |
| Endokrinologický ústav | 105 | 503 460 368 Kč |
| Národní ústav duševního zdraví | 470 | 7 310 451 359 Kč |
| Ústav hematologie a krevní transfuze Praha | 217 | 1 670 617 895 Kč |
| Revmatologický ústav | 80 | 452 236 335 Kč |
| Hygienická stanice hlavního města Prahy se sídlem v Praze | 14 | 1 300 000 Kč |
| Krajská hygienická stanice Olomouckého kraje se sídlem v Olomouci | 20 | 7 988 766 Kč |
| Krajská hygienická stanice Zlínského kraje se sídlem ve Zlíně | 23 | 36 659 322 Kč |
| Krajská hygienická stanice Jihomoravského kraje se sídlem v Brně | 23 | 46 267 161 Kč |
| Krajská hygienická stanice Ústeckého kraje se sídlem v Ústí nad Labem | 21 | 15 234 576 Kč |
| Krajská hygienická stanice Moravskoslezského kraje se sídlem v Ostravě | 34 | 4 433 748 Kč |
| Krajská hygienická stanice Středočeského kraje se sídlem v Praze | 25 | 17 451 974 Kč |
| Fakultní nemocnice Brno | 837 | 8 167 603 184 Kč |
| BALMED Praha, státní podnik | 1 | 8 500 Kč |
| Agentura pro zdravotnický výzkum České republiky | 1 | 72 678 246 Kč |
| Referenční laboratoře přírodních léčivých zdrojů | 2 | 7 975 000 Kč |
| Léčebné lázně Lázně Kynžvart | 36 | 67 182 735 Kč |
| Zdravotnické zabezpečení krizových stavů | 8 | 40 379 000 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Marianny Oranžské | 19 | 47 957 505 Kč |
| Psychiatrická nemocnice v Opavě | 72 | 559 261 059 Kč |
| Fakultní nemocnice Ostrava | 556 | 10 119 526 373 Kč |
| Psychiatrická léčebna Šternberk | 44 | 178 549 670 Kč |
| Dětská psychiatrická nemocnice | 14 | 8 585 249 Kč |
| Dětská psychiatrická nemocnice Louny | 13 | 3 522 836 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Horní Beřkovice | 69 | 262 072 640 Kč |
| Fakultní nemocnice Plzeň | 532 | 7 584 345 872 Kč |
| Psychiatrická nemocnice v Dobřanech | 37 | 619 334 655 Kč |
| Léčebna tuberkulózy a respiračních nemocí Janov | 29 | 89 635 946 Kč |
| Dětská psychiatrická nemocnice Opařany | 27 | 131 024 444 Kč |
| Hamzova odborná léčebna pro děti a dospělé | 55 | 619 626 273 Kč |
| Fakultní nemocnice Hradec Králové | 680 | 8 326 270 606 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Havlíčkův Brod | 30 | 214 773 429 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Brno | 62 | 382 432 779 Kč |
| Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně | 681 | 19 247 643 272 Kč |
| Fakultní nemocnice Olomouc | 510 | 8 590 927 180 Kč |
| JEDNA BEDNA s.r.o. | 3 | 5 698 008 Kč |
| BONA, o.p.s. | 178 | 336 528 091 Kč |
| Ústav pro péči o matku a dítě | 98 | 816 861 106 Kč |
| Psychiatrická nemocnice Jihlava | 37 | 282 748 452 Kč |
| Psychiatrická léčebna Červený Dvůr | 26 | 77 848 440 Kč |
| Institut klinické a experimentální medicíny | 597 | 6 325 013 329 Kč |